وبعد وفاة زعيم الشيعة في عصره السيد مهدي بحر العلوم سنة 1212 ه / 1797 م دفن في المسجد نفسه . وفي عصرنا كان أحد أحفاد العلّامة بحر العلوم ، وهو المجتهد السيد محمد تقي بحر العلوم يقيم صلاة الجماعة في هذا المسجد التاريخي العريق . كما كان العديد من العلماء يعقدون حلقات التدريس فيه ، أمثال الامام الشهيد السيد محمد باقر الصدر ، المقتول سنة 1400 ه / 1980 م . وبعد وفاة السيد محمد تقي خلّفه ولده السيد حسين بحر العلوم في إمامة الصلاة والتدريس . وكلّ هؤلاء الأماثل هم من أعيان العلماء في القرن الأخير .